Еуропалық популяциялардың bp үлгілеріне сүйенсек, бұл нұсқалардың әрқайсысы халықтың 5% - дан аспайды. Алайда, қазіргі уақытта геннің кем дегенде 34 нұсқасы белгілі. Осы 34 нұсқаның кем дегенде 25-і Крон ауруымен байланысты.Жұқпалы факторлар: олардың рөлі толық расталмаған, бірақ зертханалық егеуқұйрықтарға ішек шайындыларын енгізу кейде соңғысында ауру тудыруы мүмкін. Вирустық немесе бактериялық табиғат туралы болжамдар жасалды (оның ішінде MAP бактериясының әсері (Mycobacterium avium paratuberculosis), бірақ қазіргі уақытта олар мүлдем дәлелденбеген.Иммунологиялық факторлар: Крон ауруы кезінде органдардың жүйелі зақымдануы аурудың аутоиммундық сипатына әкеледі. Науқастарда патологиялық тұрғыдан жоғары T-лимфоциттер, E. coli антиденелері, сиыр сүтінің ақуызы, липополисахаридтер кездеседі. Асқыну кезеңінде науқастардың қанынан иммундық кешендер бөлінеді. Жасушалық және гуморальдық иммунитеттің бұзылуы бар, бірақ олар екінші реттік болуы мүмкін. Бұзылулардың ықтимал механизмі-бұл Т лимфоциттерінің, жасушалық макрофагтардың, фибробласттардың белсенділенуіне әкелетін, әртүрлі тіндік зақым келтіретін антиденелер, цитокиндер, простагландиндер, еркін Атом оттегін шығаратын науқастардың ішек/қан люменінде белгілі бір антигеннің болуы.
