Мэйнфреймы и суперкомпьютеры не всегда можно четко различить; Вплоть до начала 1990-х годов многие суперкомпьютеры были основаны на архитектуре мэйнфреймов с расширениями суперкомпьютеров. Примером такой системы является HITAC S-3800, который имел набор команд, совместимый с мэйнфреймами IBM System / 370 , и мог запускать операционную систему Hitachi VOS3. Таким образом, S-3800 можно рассматривать как одновременно и суперкомпьютер, и как IBM-совместимый мэйнфрейм.
