Функционалды диспепсияның асқазан-ішек жолдарының басқа ауруларымен дифференциалды диагнозы қосымша зерттеулерді талап етуі мүмкін. Асқазан рентгені арқылы органның қуысының кеңеюі анықталуы мүмкін, баяу тамақ эвакуациясы. Электрогидрография кезінде асқазанды қозғалғыштығын бұзған (көбінесе оның ырғағының төмендеуі). Асқазан шырынын зерттеудің қышқылдылығын анықтау, рН-метрі (өсуі мүмкін, сондықтан рН төмендетеді). Антродуоденальді манометрия асқазанның релаксация дәрежесін бағалау үшін пайдаланылады, оның ішінде органның қуысына арнайы сенсор салынған, қысым беру. Функционалды диспепсиямен манометрия жеткіліксіз релаксацияны немесе көрсете алады, керісінше, асқазан қабырғаларының релаксациясы.
